以中国工程院徐寿波院士为院长的北京交通大学物流研究院于2005年3月11日成立，这是北京交通大学为全面提升物流研究的水平、系统集成物流学科的优势力量而采取的举措，物流研究院将发展成为我国物流学科研究基地、高层次人才培养基地和物流领域的产学研基地。
作为我国第一个具有物流学博士学位授予权的高等学府，北京交通大学是国内较早开展交通运输、物流管理研究的院校之一，多年来一直从事交通运输优化、物流战略与规划、物流运筹等领域的研究。交通运输学科历史悠久，至今已有百年的历史；1946年创办的物资管理学科经过几十年的发展，同步印证了我国物流学科的发展历程。这些传统学科都为物流领域的教学、科研、培训积累了丰富的资料和研究经验，孕育了物流学科发展的坚实基础。近年来在物流研究方面，该校承担了包括国家自然科学基金课题、973基础研究项目、国家科技攻关计划项目在内的60多个课题项目，发表论文800多篇。
北京交通大学物流研究院目前完成了校内物流资源的共享，促进了物流教学和科研的相互交融，实现了物流学科从内容到形式的统一。新成立的物流研究院将在充分发挥原有优势的基础上，将进一步深化教学改革，提高教学层次，组织精干的学科团队，完善学科体系结构；将进一步拓展科研领域，制定引导物流产业的发展政策和规范化措施，为企业和地方政府提供物流规划设计和咨询服务，并进行特殊物流需求的专题研究；将进一步与国内外大学和企业广泛开展学术交流，谋求多种形式的合作办学，举办各种形式的学术研讨会；并将进一步提高基础研究能力与水平，创建综合物流实验室，使其成为我国物流学科研究基地、高层次人才培养基地和物流领域的产学研基地。
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